肛周脓肿是由于肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染后形成的脓肿。其特点是自行破溃，或在手术切开引流后形成窦道。常见的致病菌有大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌和绿脓杆菌，偶有厌氧性细菌和结核杆菌，常是多种病菌混合感染。由于侵润的白细胞和组织发生坏死、溶解、液化，而在局部形成了充满脓液的囊腔。小的脓肿可自行吸收而消散；大的脓肿由于脓液较多不易吸收，可由皮肤溃破或需要切开排脓。如未能自溃或及时切开排脓而成慢性脓肿时，脓肿周围被增生的肉芽组织包围形成脓肿膜。但当脓肿继续发展时，脓肿膜内层不断有白细胞渗出的组织坏死，使脓肿液增多，脓肿扩大，脓肿如若未破溃则由组织吸收，细菌或毒素进入血液，严重者可导致脓毒血症、菌血症、败血症，是肛肠科的急重症。