不少营养学家最近指出，儿童营养不良与多种因素有关，其中重要的一点便是药物因素。

许多药物可影响儿童的食欲。如治疗多动症的利太林、苯丙胺等，都有明显的抑制食欲作用；某些营养补品如肥儿灵、雅儿灵等，其糖、脂肪、蛋白质和维生素含量较高，长期过量食用，可使孩子胃口欠佳、消化不良、腹胀、腹泻等，从而导致儿童营养不良。

长期服用某些激素类药，会使儿童发育迟缓，可引起骨质疏松而发生骨折，还会使体内蛋白质、脂肪、糖等营养物质代谢紊乱，抑制蛋白质的合成，减少组织对葡萄糖的利用和再吸收。

服用氯霉素或磺胺等广谱抗生素的儿童，可因抑制肠道正常菌群的生长，而发生维生素K缺乏，出现鼻出血、皮下瘀血点等；服用新霉素能引起肠粘膜细胞的缺损，使胰酯酶下降，从而阻碍脂肪、乳糖、蔗糖、维生素B12、钙、铁等的消化吸收；口服四环素可使维生素B2的排出量增加。

常用的抗结核药，如异烟肼，可减少体内维生素B6的含量，使儿童易发生周围神经炎；对氨基水杨酸钠能阻滞肠道摄取脂肪、维生素B12，异烟肼与对氨基水杨酸钠均可妨碍对酸的吸收，导致儿童运动红细胞性贫血症。

某些镇静药、镇痛药如苯巴比妥、苯妥英、扑痫酮、保泰松、吲哚美辛及糖皮质激素等，可阻碍维生素D、钙、磷、维生素K的吸收及利用，直接影响儿童骨骼的发育，导致儿童佝偻病。阿司匹林是儿童的常用药物，它可使人体对维生素C的利用率大幅降低，增加维生素C在尿中的排泄，导致维生素C缺乏症。

有的家长给儿童服用过量鱼肝油，会导致儿童腹泻，造成吸收不良，甚至维生素A、维生素D中毒。儿童大量服用维生素C，破坏了食物中的维生素B2，亦可导致运动红细胞性贫血症。

此外，儿童常服缓泻剂可使大量胡萝卜素、钙以及维生素A、维生素D、维生素K等从肠道丢失；常服碳酸氢钠可干扰铁的吸收，引起儿童贫血等缺铁性疾病；常服青霉胺、乙胺丁醇等药可导致儿童锌缺乏；长期应用大剂量庆大霉素以及利尿剂等，可导致低镁症。